在“211工程”和“985工程”建设中，中南大学充分认识到两大工程给学校带来宝贵发展资金的同时，也是学校加强民主管理、激发办学活力的重要平台。近年来，学校认真落实“三重一大”制度，建立健全科学民主决策与管理机制，充分激发了两大工程在学校科学发展中的引领和核心支撑作用。
一是贯彻群众路线，建立民主参与机制，凝聚发展合力。“211工程”和“985工程”是增强学校核心竞争力的系统工程，事关学校发展，需要集全校之力重点推进。为此，学校在工程建设特别是立项论证和总结考核工作中，广泛深入地发动群众，在全校范围内专题动员，统一部署，明确要求，定期通报工作进展及成效，大力营造全校上下共同关心和积极参与两大工程建设的良好氛围。学校还不定期召开座谈会，征求党外人士对重点项目的实施意见，充分发挥民主党派和党外人士的民主监督作用，凝心聚力，共谋发展。
二是坚持学术主导，健全民主决策机制，优化资源配置。“十五”以来，中南大学共计获得两大工程专项资金7亿多元，主要用于以国家重点学科为核心的平台队伍建设。为贯彻“基础研究瞄准国际学术前沿，应用研究结合国家重大需求”的建设方针，学校成立由院士等学科带头人组成的重点学科建设专家指导委员会，为科学决策提供高层咨询；成立以校领导为主组成的两大工程建设领导小组，为工程实施提供组织保障。如，在2008年“211工程”三期规划编制及论证期间，学校先后三次召开专家论证会研讨规划，四次召开校务会落实方案，形成了“学术引领，行政推动”的科学决策机制。学术主导作用同样体现在“985工程”建设中。如，学校材料与资源学科领域有两院院士11人,在“985工程”有色金属材料及其资源Ⅰ类科技创新平台建设中，院士们的协力引领相关国家重点学科有机融合，催生出对接国家重大需求的平台主攻方向，汇聚高端创新人才队伍。该平台自2004年立项建设以来，获国家三大科技奖励一等奖4项、二等奖10项、承担“973”首席科学家项目5项。
三是实施共建共管，完善民主监督机制，严把工程质量。一是健全制度，多部门协作规范项目运行。出台实施专项资金与设备管理、招投标和项目审计及档案管理等办法，重点加强专项资金稽查和审计及大型设备管理，其中，对拟购10万元以上设备、20万元以上大宗物资实行招投标管理。二是加强沟通，全过程跟踪实行动态监控。在学校领导小组宏观调控和项目单位自主管理相结合的基础上，建立职能部门与项目所在二级单位的对口联系制度，定期召开工作情况通报与研讨会，及时掌握项目进展，对可望产生标志性成果的项目重点支持。强化考核，责权利结合严控建设计划。学校将两大工程建设任务纳入当年党政工作要点予以重点督办，与各项目负责人分别签订任务书，严格执行工程计划，并把项目建设绩效纳入项目单位的年度工作考核。
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